По маркетинговым причинам, в основном.
Изначально он назывался Mocha, потом LiveScript, и когда Netscape и Sun Microsystems заключили партнёрство, в рамках этого самого партнёрства он был переименован в JavaScript.
JavaScript и Java — это два совершенно разных языка программирования с разным синтаксисом, семантикой и назначением.
Java в середине 90-х была "модным трендом". Из-за маркетинга авторы JavaScript и подцепились к тому что на слуху. Сейчас скорее всего у них такой трюк не получился бы из-за авторских прав на "бренды", но в 90-е, как видим, такое проходило