Снижение скорости происходит от : фрагментации в принимающем диске. количества файлов. изза отдельного доступа к дискам с стороны ОС. ССД занят больше чем на 70%. антивирус проверяет на лету.
Нужно проверять отдельно по всем позициям и вместе
Через диспетчер задач, вкладку Производительность погляди, какой из дисков долбится в сотку. Если на линуксе - то через atop можно глянуть к примеру.
Если копируешь в пределах одного диска на его же самого - то в случае с HDD скорость будет проседать, если начальный и конечный файл физически расположены далеко друг от друга, головкам позиционироваться долго нужно.