База заполняется: при создании таблицы значениями по умолчанию; при помощи тех же sql запросов (INSERT INTO table_name...), вручную или специально написанной программой, копирующей в базу ту же таблицу экселя.
Нет, там свои таблицы, которые предварительно нужно создать или импортировать из дампа существующей БД. Если устанавливаете какой-нибудь сторонний скрипт, то там обычно в комплекте есть инсталлятор, создающий нужные для него таблицы и забивающий их начальными данными.